张涛 , 黄华梅 , 徐玲 , 吴晓媚 , 袁长春 , 蒋边 , 刘锴栋^*

岭南师范学院生命科学与技术学院, 湛江, 524048
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 7 篇   
收稿日期: 2019年05月06日    接受日期: 2019年05月17日    发表日期: 2020年08月21日

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MYB 基因家族作为高等植物最大的一类转录因子家族，调节植物的生长发育及代谢。到目前为止，针对番木瓜 MYB 转录因子家族的研究仍相对较少。本研究基于番木瓜转录组测序数据，筛选出 34 个在番木瓜果实成熟过程中表达显著差异的 MYB 类转录因子基因，并对其蛋白序列进行理化性质、亚细胞定位和系统进化等生物信息学分析。本研究依据 MYB 保守域的个数将 34 个番木瓜 MYB 类转录因子分为1R-MYB 和 R2R3-MYB 两类。上述 MYB 基因编码蛋白的氨基酸数目在 141~1 709 个之间，其分子量分布在 16 312.94~186 299.92 Da 范围内，皆为不稳定的亲水性蛋白。上述 34 个蛋白均不含信号肽，绝大部分以α- 螺旋与无规卷曲为主要的二级结构元件。亚细胞定位分析表明，番木瓜 MYB 蛋白主要分布在细胞核。进化树分析显示番木瓜 MYB 蛋白与拟南芥 MYB 蛋白可被分为三个亚类，即亚类聚类玉、域和芋，推测聚在同一个亚类上的转录因子可能具有相似的功能。研究结果为进一步探究 MYB 家族的基因功能提供了基础数据，也为其他物种 MYB 转录因子的研究分析提供一定的帮助。
 

番木瓜(Carica papaya L.)；MYB 转录因子；转录组；生物信息学